En los años ochenta, la NBA se vio sacudida por la irrupción de los Pistons. Lanier jugó tanto para los Detroit Pistons como para los Milwaukee Bucks antes de retirarse de la NBA. Sería su regreso al fútbol argentino, como entrenador y con el objetivo de salvar a Gimnasia del descenso, el cual estaba cada vez más comprometido en el fondo de la tabla de los promedios. Sin embargo, eso no lo detuvo y, tras vencer por 4 a 2 en Dock Sud, consiguió el ascenso en Lomas al vencer por 7 a 3. Habiendo conseguido el retorno a Primera División luego de 35 años, enfrentó en la final a Atlanta, que retornaría a Primera luego de 17 años a costa de eliminar ni más ni menos que a River Plate: venciendo por 4 a 2 en Dock Sud y cayendo por 4 a 3 en Villa Crespo, consigue el campeonato al golear por 7 a 2 en el último partido en Ezpeleta, consagrándose campeón por primera vez en su historia. En 2020 inició una nueva temporada de la Primera B, donde el lobo arrancó con una goleada sobre quien lo había eliminado en el certamen anterior.
El 2019 recibió al lobo en Primera B, resultado de 2 ascensos consecutivos obtenidos desde 2017. En su debut en la categoría haría la mejor campaña de los últimos años, siendo merecedor del ascenso, pero el formato de las 2 categorías superiores era distinto al de la Primera C y Primera D: al cabo de 38 fechas, Gimnasia terminó en primer puesto igualando con Camioneros en 82 puntos, por diferencia de gol quedó con la posición mencionada; sin embargo los 2 ascensos debían definirse en la fase final, donde accedieron los 8 mejores de la Tabla de posiciones. El equipo de baloncesto de Gimnasia y Esgrima alcanzó su punto máximo durante las campañas de 1978 y 1979. El primer título que obtuvo fue en 1978 al vencer en el estadio de Ferrocarril Oeste a Obras Sanitarias por 72 a 67 el título Metropolitano. Es uno de los clubes miembros fundadores de la Federación Argentina de Esgrima (FAE) en 1921. A fines de la década del cuarenta se deja de practicar esta disciplina. En el año 2013, el equipo de primera división dirigido por César «Conejo» Adriani, participa del torneo provincial de clubes con la base de jugadores de las divisiones inferiores más los refuerzos de Leonardo La Bella y Gonzalo Marín, consiguiendo uno de los dos ascensos al Torneo Federal luego de ganar la semifinal en 3.er partido frente al Club Del Acuerdo de San Nicolás.
El club ocupa el puesto número 26.º en la tabla histórica de la Liga Nacional de la Asociación de Clubes de Básquetbol con 366 puntos en 244 partidos. En 2017, bajo la dirigencia de Gabriel Pellegrino, y luego de que la CONMEBOL anunciara importantes cambios en la estructura de los torneos internacionales, obligando a los participantes a poseer un equipo femenino y otro juvenil, el club reabre esta disciplina, y a partir de junio comienza a disputar la División B de la Asociación del Fútbol Argentino, bajo el mando de Federico Quiroga. Tras una primera parte de temporada irregular en la liga y la marcha de algunos jugadores como Daniel Wass durante el mercado de invierno, el Valencia Club de Fútbol se cuela en semifinales de copa y se hace con los servicios de Ilaix Moriba, Bryan Gil cómo cedidos, y Eray Cömert como adquisición por menos del millón de euros.
Este éxito impulsó a aquellos jugadores a constituirse definitivamente en una entidad legalmente establecida e independiente del Club Ciclista. La esgrima fue el primer deporte oficial del club. El baloncesto (o básquetbol) comenzó a practicarse en el club de Gimnasia y Esgrima La Plata en la década de 1920 y en el año 1924 se construyó una cancha en el predio de 60 y 118. A partir de ese momento, se convertiría en uno de los principales deportes practicados en el club. El partido se disputó el 5 de diciembre en Avellaneda en cancha de S.E.C.L.A. Pelota paleta: En julio de 1943 es habilitada la cancha de pelota paleta y gran cantidad de socios se inscriben en sus categorías. Su equipo, conocido popularmente como Las Lobas han participado en una gran cantidad de títulos a nivel nacional y metropolitano, obteniendo también diversos títulos. La institución posee al 2018 una importante cantidad de disciplinas relacionadas con las artes marciales; todas ellas de carácter amateur.